З метою забезпечення виконання основних завдань щодо запобігання проявів корупції в структурі Головного управління ДФС у Кіровоградській області функціонує відділ внутрішньої безпеки, основною функцією якого є організація та проведення профілактичної роботи серед працівників територіальних органів служби, для попередження вчинення ними злочинів у сфері службової діяльності, корупційних діянь та інших порушень вимог чинного законодавства.
У січні-лютому 2016 року працівниками відділу внутрішньої безпеки Головного управління ДФС у Кіровоградській області проведено 86 лекцій, виступів, бесід з працівниками органів ГУ ДФС у Кіровоградській області щодо недопущення корупційних дій та порушень законодавства України у сфері службової діяльності.
З початку року працівниками відділу внутрішньої безпеки здійснено 10 перевірок відносно посадових осіб податкової та митної служби у Кіровоградській області. За наслідками проведених службових розслідувань і перевірок внесено 3 подання про притягнення винних осіб до відповідальності та усунення причин та умов, що сприяли вчиненню порушень. За наслідками розгляду подань 2 посадові особи притягнуто до дисциплінарної відповідальності.
Крім того, за матеріалами відділу внутрішньої безпеки слідчим відділом прокуратури Кіровоградської області у лютому ц.р. розпочато кримінальне провадження (ч.2 ст.364 КК України) відносно посадових осіб ОДПІ.